Оподаткування фіксованим сільськогосподарським податком сільськогосподарських товаровиробників здійснюється відповідно до глави 2 Розділу XIV Податкового кодексу України.

Основними порушеннями, які допускаються суб’єктами господарювання – платниками фіксованого сільськогосподарського податку, є, зокрема, невірне визначення частки сільськогосподарського товаровиробництва для набуття і підтвердження статусу платника податку в порушення ст. 301 Податкового кодексу України. Також трапляються випадки неповного включення до розрахунку фіксованого сільськогосподарського податку земельних ділянок, що фактично використовуються у господарській діяльності, чим занижується об’єкт та база оподаткування в порушення ст.302 та ст.303 Податкового кодексу України. Згідно з ст. 308 Кодексу реєстрація сільськогосподарського товаровиробника платником податку скасовується за рішенням контролюючого органу у разі встановлення за результатами документальної перевірки недотримання платником податку положень статті 301. При цьому такий платник податку зобов'язаний перейти до сплати податків за загальною системою оподаткування, починаючи з наступного місяця після місяця, у якому було встановлено таке порушення. Основною метою висвітлення даних типових порушень є намагання допомогти платникам чітко дотримуватися вимог Податкового кодексу України, недопущення випадків заниження належних до сплати сум податків та запобігання додаткових фінансових витрат платників у вигляді фінансових санкцій.